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PKMITO系列線粒體超分辨探針常見問題咨詢

1.QPKMITO可以染植物細(xì)胞線粒體嗎

A:目前測試了幾種植物樣本,衣藻、花粉管都有成功的案例,根尖細(xì)胞和擬南芥葉片效果都不理想,所以一般不推薦使用PKMITO染料標(biāo)記植物細(xì)胞線粒體。除了帶細(xì)胞壁的樣本存在透膜問題,植物細(xì)胞線粒體內(nèi)外膜電勢差也比動物細(xì)胞小,所以也可能存在標(biāo)記問題。原生質(zhì)體可以染,但效果一般。

2.Q:維拉帕米的用法

A對于一些不容易透膜標(biāo)記靶點的染料,在不影響實驗設(shè)計的前提下,我們推薦使用維拉帕米(一種鈣通道阻滯劑)增加染料在細(xì)胞內(nèi)的保留,以提高染色效率,染料是否推薦搭配使用請參考染料的網(wǎng)站介紹或網(wǎng)站產(chǎn)品詳情頁的電子版說明書。

具體用法一般建議是1-10μM濃度,在整個染色到拍攝的全過程中都使用,例如在配置染色工作液時即加入適當(dāng)濃度的維拉帕米,然后進(jìn)行孵育染色,在染色結(jié)束如果進(jìn)行進(jìn)一步清洗,那么在清洗后仍然加入適當(dāng)濃度的維拉帕米,以保證長時間拍攝時的穩(wěn)定性。推薦貨號:麥克林 V875827;中國上海

3.Q:線粒體探針染了細(xì)胞,熒光能保留多久

A在以往的實驗中,用PKMITO染料染完色后,細(xì)胞傳一代基本都還能保留熒光,所以幾天之內(nèi)基本上都有熒光。

4.Qactin染料和fastact有什么區(qū)別

A:這兩款染料分子上帶的定位基團(tuán)不一樣,fastact系列是迭代的更優(yōu)化的版本,生物相容性更好,細(xì)胞毒性更低。但化學(xué)結(jié)構(gòu)的優(yōu)化不代表在每種生物樣本中都能帶來優(yōu)化的效果,成像最終效果或許沒有質(zhì)的差別。

5.Qspirochrome的染料能不能用在植物或者海洋生物中

A:膜張力探針可以用在植物細(xì)胞上,其他染料不能。Tag類的染料可以標(biāo)記,但需要轉(zhuǎn)染表達(dá)的操作。“All our probes do not work in live plants and whole marine organisms (e.g. sea urchin embryos, jellyfish, sea star, etc) with the exception of Flipper-TR, which has been shown to work in plants.It seems the probe do not penetrate into the cells due to additional barriers (e.g. cell wall)

6.QPKZinc系列幾種染料的區(qū)別

APKZnR-5的親和力最強(qiáng) 信噪比也最高 所以檢測信號的效果最好;換句話說1能做的實驗5理論上都能做的更好,R1-R5本質(zhì)區(qū)別就是親和力,R1 FR1/2/3的親和力都一樣 都比R5低不少。

7.Q:幾款線粒體染料有什么區(qū)別

APKMITO系列四款產(chǎn)品:前三個是活細(xì)胞染料,是最好用熱度最高的,它們有兩個區(qū)別:一是激發(fā)通道不同,成像質(zhì)量都一樣,是超分辨水平的染料,抗淬滅、低光毒性;二是orange這款更適合做STED成像,另外兩個通道不適合拍STED;第四款帶FIX后綴的是可固定版本染料,也需要活細(xì)胞染色,染完后可以固定,但是這款染色沒有活細(xì)胞染料易用,對技術(shù)要求更高一些,摸條件的難度更高。

PK Mito Orange Fix這款染料的使用難度大,不適合做超分辨比較少的用戶,它的透膜效率在一些細(xì)胞種類上較低,染色條件不好摸,僅照著說明書的話不容易做出來,而且不管哪個角度,固定后的線粒體,成像效果是不如活細(xì)胞的,因為不管怎么固定,線粒體肯定都會有損傷,所以這款染料只是提供了固定線粒體拍攝的一種解決方案,但并不具有普適性,只適合進(jìn)階玩家或者特殊實驗需求。當(dāng)然我們還在開發(fā)使用更簡單的fix染料,提高fix染料的使用范圍,目前還在研發(fā)過程中。

HBmito這款產(chǎn)品作為線粒體染料的新品,主打遠(yuǎn)紅通道的STED顯微鏡成像場景的應(yīng)用,其作為活細(xì)胞染料的話,成像性能略遜于PKMITO系列,但PKMITO系列不支持遠(yuǎn)紅通道的STED應(yīng)用;而且HBmito是允許固定的,固定后的效果比mitotracker稍好一些,固定后是否能做超分辨,我們還在測試。

8.Q:線粒體染色后背景過高或者線粒體形態(tài)不好有哪些可能,怎么優(yōu)化?

A:背景過高,導(dǎo)致線粒體信號太強(qiáng)看不出來形態(tài),首先考慮染色濃度太高了,可以將染色濃度降低一些,考慮12000或者更低(根據(jù)實際成像結(jié)果或者信號強(qiáng)度判斷),還有不要室溫染色,線粒體本來就是對環(huán)境敏感的細(xì)胞器,除非樣品本身孵育溫度就是室溫,否則要在37℃,其次在染完色后,可以用共聚焦設(shè)備/模式看看染色效果,看一是背景是否過高,二是線粒體形態(tài)是否良好,如果都不錯,清洗1-2次后換上新的預(yù)熱的培養(yǎng)基,再孵育20-30min,這樣線粒體形態(tài)會更好,背景會更低。

超分辨成像是很綜合很注重細(xì)節(jié)的實驗,所謂三分染色七分拍,一定要注意樣本的狀態(tài)是否良好,樣本狀態(tài)對于成像結(jié)果的影響比想象中要大很多,也不必拘泥于說明書步驟,因為實驗影響因素太多,說明書只能提供一些基礎(chǔ)框架,這種操作上的寬容度既是超分辨實驗的的優(yōu)勢也是難點,一定是要參考實際成像效果進(jìn)行條件優(yōu)化的,優(yōu)化的目的是用最少的染料,完成染色標(biāo)記需求,減少各種試劑對細(xì)胞的影響。

9.Q:有沒有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)染料

A:沒有,目前推薦的超分辨標(biāo)記內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的方式為轉(zhuǎn)染熒光蛋白(超分辨門檻,適用于SIM顯微鏡并向下兼容);或者利用蛋白標(biāo)簽技術(shù)如Halo Tag蛋白標(biāo)簽或者SNAP蛋白標(biāo)簽,先利用標(biāo)簽質(zhì)粒在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上表達(dá)相應(yīng)的tag,再利用CA或者BG系列產(chǎn)品去標(biāo)記tag,這是一種穩(wěn)定的間接標(biāo)記手段,依賴于我們優(yōu)化的CA/BG系列探針,可達(dá)到穩(wěn)定的超分辨成像效果(適用于STED、SIM顯微鏡并向下兼容)。

相關(guān)產(chǎn)品:

貨號

名稱

規(guī)格

PKMR-1

PK MITO Red 線粒體超分辨探針紅色

25nmol/支

PKMR-2

PK MITO Red線粒體超分辨探針紅色

5nmol/

PKMDR-1

PK MITO Deep Red線粒體超分辨探針深紅色

25nmol/

PKMDR-2

PK MITO Deep Red線粒體超分辨探針深紅色

5nmol/

PKMO-1

PK MITO Orange 線粒體超分辨探針橙色

25nmol/支

PKMO-2

PK MITO Orange線粒體超分辨探針橙色

5nmol/

PKMOF-1

PK Mito Orange Fix

50

PKMOF-2

PK Mito Orange Fix

10

PKZR-1

PKZinc Red 鋅離子超分辨探針紅色

500ug

PKZR-5

PK Zinc Red-5 鋅離子超分辨探針紅色

500ug

PKZFR-1

PKZinc Far Red鋅離子超分辨探針遠(yuǎn)紅色

50ug/

 

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